合同包

品目号

品目名称

主要技术参数及要求

数量

成交单价（元）

成交总价（元）

成交人

地址

1

1-1

280份真菌GWAS测序分析服务

1、基于简化基因组SLAF测序技术，构建SLAF文库，完成280份个体的测序工作；平均每个样品获得10万个标签，测序平均深度不低于10×，保证Q30达到80%。

2、数据分析要求包括以下内容：

2.1测序数据质控

a)原始数据统计

b)碱基测序质量分布

c)碱基类型分布

d)低质量数据过滤

e)数据质量评估测序数据质控。

2.2与参考基因组比对统计

a)比对结果统计

b)插入片段分布统计

c)测序深度及覆盖度统计

2.3全基因组变异检测:全基因组范围内的SNP和InDel检测

2.4遗传进化分析

a)系统发育树构建

b)群体结构分析

c)主成分PCA分析

d)亲缘关系分析

2.5 LD连锁不平衡分析

2.6全基因组关联分析

a)SNP与性状关联分析（TASSEL软件中GLM和MLM模型）

b)候选基因功能注释（NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, Pfam）

280份

335

93800

北京百迈客生物科技有限公司

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